<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">fcmedicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фундаментальная и клиническая медицина</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Fundamental and Clinical Medicine</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2500-0764</issn><issn pub-type="epub">2542-0941</issn><publisher><publisher-name>КемГМУ</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.23946/2500-0764-2019-4-3-68-76</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">fcmedicine-163</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCH</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Многолетняя динамика и интенсивность эпидемического процесса сибирского клещевого тифа в федеральных округах и субъектах Российской Федерации в период 2002–2018 гг.</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Long-term dynamics and epidemic intensity of Siberian tick typhus in federal districts and regions of Russian Federation during 2002-2018</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4509-1212</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Штрек</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shtrek</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций;</p><p>аспирант кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии,</p><p>644080, г. Омск, Проспект Мира, д. 7</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, DSc, Chief Executive Officer, 7, Mira Prospekt, Omsk, 644080;</p><p>Head of the Department of Microbiology, Virology and Immunology, 12, Lenina Street, Omsk, 644099</p></bio><email xlink:type="simple">studi1990@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9566-9214</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рудаков</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rudakov</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, директор;</p><p>заведующий кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии,</p><p>г. Омск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, DSc, Deputy Chief Executive Officer, 7, Mira Prospekt, Omsk, 644080;</p><p>Professor, Department of Microbiology, Virology and Immunology, 12, Lenina Street, Omsk, 644099</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7220-4366</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Пеньевская</surname><given-names>Н. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Penjevskaya</surname><given-names>N. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., доцент, заместитель директора по научной работе;</p><p>профессор кафедры эпидемиологии,</p><p>г. Омск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, Methodologist, 7, Mira Prospekt, Omsk, 644080;</p><p>Assistant Professor, Department of Life Safety and Disaster Medicine, 12, Lenina Street, Omsk, 644099</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0920-0100</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Савельев</surname><given-names>Д. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Saveliev</surname><given-names>D. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>врач-методист;</p><p>ассистент кафедры безопасности жизнедеятельности, медицины катастроф,</p><p>г. Омск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, Junior Researcher, Department of Epidemiological Surveillance and Methodology,7, Mira Prospekt, Omsk, 644080;</p><p>PhD Student, Department of Microbiology, Virology and Immunology, 12, Lenina Street, Omsk, 644099</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0756-2271</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Блох</surname><given-names>А. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Blokh</surname><given-names>A. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>ладший научный сотрудник отдела эпидемиологического надзора и методической работы;</p><p>аспирант кафедры эпидемиологии,</p><p>г. Омск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, Junior Researcher, Department of Epidemiological Surveillance and Methodology, 7, Mira Prospekt, Omsk, 644080;</p><p>PhD Student, Department of Microbiology, Virology and Immunology, 12, Lenina Street, Omsk, 644099</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора;&#13;
ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Omsk Research Institute of Natural Focal Infections;&#13;
Omsk State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2019</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>30</day><month>09</month><year>2019</year></pub-date><volume>4</volume><issue>3</issue><fpage>68</fpage><lpage>76</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Штрек С.В., Рудаков Н.В., Пеньевская Н.А., Савельев Д.А., Блох А.И., 2019</copyright-statement><copyright-year>2019</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Штрек С.В., Рудаков Н.В., Пеньевская Н.А., Савельев Д.А., Блох А.И.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Shtrek S.V., Rudakov N.V., Penjevskaya N.A., Saveliev D.A., Blokh A.I.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/163">https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/163</self-uri><abstract><sec><title>Цель</title><p>Цель. Проанализировать интенсивность и динамику заболеваемости сибирским клещевым тифом (СКТ) на различных административных территориях Российской Федерации за многолетний период и дать прогноз развития эпидемического процесса на 2019 год.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Проведен анализ заболеваемости СКТ в РФ за 2002–2018 гг. стандартными статистическими методами с использованием пакета прикладных программ Microsoft Excel 2016. Градацию оценочной шкалы уровней заболеваемости проводили с использованием методики определения доверительных интервалов медианы по ГОСТ РИСО 16269-7- 2004 «Статистическое представление данных. Медиана. Определение точечной оценки и доверительных интервалов».</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. Проведено ранжирование субъектов РФ по уровням заболеваемости СКТ и определены тенденции развития эпидемического процесса в зависимости от степени эпидемической опасности территории. Ежегодно в течение всего анализируемого периода заболеваемость СКТ регистрировалась в 17 субъектах РФ. В шести субъектах РФ выявлен тренд на снижение интенсивности эпидемического процесса (Алтайский и Красноярский края, Республика Хакасия, Амурская, Тюменская, Иркутская области). Исключение составляют Республика Тыва, Хабаровский край, Новосибирская и Омская области, в которых вероятен дальнейший рост заболеваемости СКТ. В остальных субъектах (Республики Алтай и Бурятия, Еврейская АО, Курганская и Кемеровская области, Забайкальский и Приморский края) уровень заболеваемости будет варьировать в пределах доверительных интервалов среднемноголетних значений.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Рекомендуется мониторинг активности и структуры природных очагов СКТ на эндемичных территориях юга Азиатской части России различной степени эпидемической опасности с акцентом на территории, где выявлен тренд к повышению заболеваемости. </p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Aim</title><p>Aim. To analyze epidemic intensity and long-term dynamics of Siberian tick typhus (STT) in Siberian and Far Eastern regions of Russian Federation.</p></sec><sec><title>Materials and Methods</title><p>Materials and Methods. We analyzed STT incidence in different regions of Siberia and Far East during 2002-2018 utilising standardised data. Regions were further ranked according to incidence levels.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. Cases of STT were regularly documented in 17 regions of Siberia and Far East. In six regions (Republic of Khakassia, Altai, Amur, Tyumen, Irkutsk, and Krasnoyarsk Region), a declining trend was revealed while in four regions there was a trend towards an increase in STT incidence (Republic of Tyva, Khabarovsk Region, Novosibirsk Region, and Omsk Region).</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. The monitoring of STT foci and reservoirs natural foci in endemic areas in Central Asia is needed to predict the trends in STT incidence in Siberia and Far East. </p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>сибирский клещевой тиф</kwd><kwd>клещевые риккетсиозы</kwd><kwd>заболеваемость</kwd><kwd>прогноз</kwd><kwd>Rickettsia sibirica</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Siberian tick typhus</kwd><kwd>tick-borne rickettsioses</kwd><kwd>morbidity</kwd><kwd>forecast</kwd><kwd>Rickettsia sibirica</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы: руководство для врачей. Омск: ООО «Издательский центр Омский научный вестник», 2016.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov N.V. Rickettsia and rickettsioses: a guide for doctors. Omsk: FBUN Omskij NII prirodno-ochagovyx infekcij;2016.(In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А. Проблемы лабораторной диагностики риккетсиозов. Группы клещевой пятнистой лихорадки. Клиническая лабораторная диагностика. 2015;60(1):50-52.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Samojlenko IE, Reshetnikova TA. The problems of laboratory diagnostic of rickettsiosis of group spotted tick-bite fever in Russia. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2015;60(1):50-52. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Колпаков С.Л., Яковлев А.А. О методологии оценки эпидемиологической ситуации. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2015;20(4):34-39.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kolpakov SL, Yakovlev AA. About assessment of the methodology of the epidemiological situation. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. 2015;20(4):34-39. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Транквилевский Д.В., Пакскина Н.Д., Савельев Д.А., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А., Кумпан Л.В., Пеньевская Н.А. Особенности эпидемической ситуации по сибирскому клещевому тифу и другим клещевым риккетсиозам в Российской Федерации, прогноз на 2019 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2019;(1):89- 97. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-1-89-97</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Shpynov SN, Trankvilevskij DV, Pakskina ND, Savelev DA, Samojlenko IE, Reshetnikova TA, Kumpan LV, Penevskaya NA. Features of the Epidemiological Situation on Siberian Tick Typhus and other Tick-Borne Ricketsioses in the Russian Federation, Prognosis for 2019. Problemy osobo opasnykh infektsiy. 2019;(1):89-97. (In Russ.). DOI: 10.21055/0370-1069-2019-1-89-97</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Березкина Г.В., Штрек С.В., Зеликман С.Ю., Боброва О.А., Околелова Н.А., Коломеец А.Н., Самойленко И.Е., Рудакова С.А., Петрова Ю.А., Любенко А.Ф., Кумпан Л.В. Комплексное выявление возбудителей природно-очаговых инфекций методом ПЦР в снятых с людей переносчиках в Омской области. Национальные приоритеты России. 2016;(4(22)):78-85.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Berezkina GV, Shtrek SV, Zelikman SY, Bobrova OA, Okolelova NA, Kolomeec AN, Samojlenko IE, Rudakova SA, Petrova YA, Lyubenko AF, Kumpan LV. Integrated Detection of Natural Focal Infections Agents in the Removal Vectors From People in Omsk Region. Natsional'nye prioritety Rossii. 2016;4:78-85. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Абрамова Н.В., Штрек С.В., Шаламова Е.В., Пеньевская Н.А., Рудакова С.А., Самойленко И.Е., Березкина Г.В., Зеликман С.Ю., Кумпан Л.В., Матущенко Е.В., Наумкина Е.В. Клинико-лабораторная диагностика клещевых риккетсиозов на территориях низкого риска инфицирования Rickettsia sibirica. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(11):717-721. DOI: 10.18821/0869-2084-2018-63-11-717-721</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Abramova NV, Shtrek SV, Shalamova EV, Penevskaya NA, Rudakova SA, Samojlenko IE, Berezkina GV, Zelikman SY, Kumpan LV, Matushhenko EV, Naumkina EV. Clinical and laboratory diagnosis of tick-borne rickettsioses in areas of low risk of infection with Rickettsia sibirica. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2018;63(11):717-721. (In Russ.). DOI: 10.18821/0869-2084-2018-63-11-717-721</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Рудакова С.А., Кумпан Л.В., Белан Ю.Б., Решетникова Т.А., Шпынов С.Н., Абрамова Н.В., Коломеец А.Н. О роли Rickettsia raoultii в эпидемиологии клещевых риккетсиозов в России. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2015;(3):17-21.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Samojlenko IE, Rudakova SA, Kumpan LV, Belan YB, Reshetnikova TA, Shpynov SN, Abramova NV, Kolomeec AN. On the role of Rickettsia raoultii in the epidemiology of tick-borne rickettsioses in Russia. Meditsinskaya parazitologiya i parazitarnye bolezni. 2015;3:17-21. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Иголкина Я.П., Рар В.А., Епихина Т.И., Тикунов А.Ю., Краснова Е.И., Проворова В.В., Хохлова Н.И., Савельева М.В., Тикунова Н.В. Выявление ДНК Rickettsia raoultii и Rickettsia sibirica в крови и ликворе пациентов в Западной Сибири. Национальные приоритеты России. 2016;4 (22):85-88.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Igolkina YP, Rar VA, Epixina TI, Tikunov AY, Krasnova EI, Provorova VV, Xoxlova NI, Saveleva MV, Tikunova NV. DNA detection of Rickettsia raoultii and Rickettsia sibirica in the blood and cerebrospinal fluid of patients in Western Siberia. Natsional'nye prioritety Rossii. 2016;4(22):85-88. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Штрек С.В., Рудаков Н.В., Абрамова Н.В., Самойленко И.Е., Березкина Г.В., Зеликман С.Ю., Кумпан Л.В., Матущенко Е.В. Оценка эффективности серологических методов для выявления антител у больных клещевыми риккетсиозами на территориях различного риска заражения Rickettsia sibirica. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(11):777-782.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shtrek SV, Rudakov NV, Abramova NV, Samojlenko IE, Berezkina GV,Zelikman SY, Kumpan LV, Matushhenko EV. Evaluation of the effectiveness of serological methods for the detection of antibodies in patients with tick-borne rickettsiosis in areas of different risk of infection with Rickettsia sibirica. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2018;63(11):777-782. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
