fcmedicineФундаментальная и клиническая медицинаFundamental and Clinical Medicine2500-07642542-0941КемГМУ10.23946/2500-0764-2022-7-2-45-55fcmedicine-548Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL RESEARCHОпыт расчета эпидемических порогов заболеваемости внебольничной пневмониейCalculation of epidemic thresholds for incidence of community-acquired pneumoniahttps://orcid.org/0000-0002-1324-7374БотвинкинА. Д.BotvinkinA. D.

Ботвинкин Александр Дмитриевич, доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой эпидемиологии

664003, г. Иркутск, ул. Красного восстания, д. 1

Dr. Alexander D. Botvinkin, MD, DSc, Head of Department of Epidemiology

1, Krasny Vosstaniya Street, Irkutsk, 664003

botvinkin_ismu@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9839-6629КравченкоН. А.KravchenkoN. A.

Кравченко Наталья Александровна, ассистент кафедры эпидемиологии

664003, г. Иркутск, ул. Красного восстания, д. 1

Dr. Natalia А. Kravchenko, MD, Assistant Professor, Department of Epidemiology

1, Krasny Vosstaniya Street, Irkutsk, 664003

https://orcid.org/0000-0003-4289-3460БаяноваТ. А.BayanovaT. A.

Баянова Татьяна Александровна, кандидат медицинских наук, доцент кафедры эпидемиологии

664003, г. Иркутск, ул. Красного восстания, д. 1

Dr. Tatiana A. Bayanova, MD, PhD, Associate Professor, Department of Epidemiology

1, Krasny Vosstaniya Street, Irkutsk, 664003

https://orcid.org/0000-0003-2988-1414ХакимоваМ. И.KhakimovaM. I.

Хакимова Марьяна Ивановна, заведующая эпидемиологическим отделом

664047, г. Иркутск, ул. Трилиссера, д. 51

Dr. Maryana I. Khakimova, MD, Head of the Department of Epidemiology

51, Trilissera Street, Irkutsk, 664047

https://orcid.org/0000-0001-9212-6134ГавриловаТ. А.GavrilovaT. A.

Гаврилова Татьяна Анатольевна, заместитель начальника эпидемиологического отдела

664003, г. Иркутск, ул. Карла Маркса, д. 29

Dr. Tatiana A. Gavrilova, MD, Deputy Head of the Department of Epidemiology

29, Karl Marx Street, Irkutsk, 664003

https://orcid.org/0000-0002-9250-2440ЛихановаН. А.LikhanovaN. A.

Лиханова Надежда Алексеевна, заведующая отделом эпидемиологического надзора

664003, г. Иркутск, ул. Карла Маркса, д. 4

Dr. Nadezhda A. Likhanova, MD, Head of the Department of Epidemiological Surveillance

4, Karl Marx Street, Irkutsk, 664003

ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияIrkutsk State Medical UniversityRussian FederationФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»РоссияCenter for Hygiene and Epidemiology in the Irkutsk RegionRussian FederationМинистерство здравоохранения Иркутской областиРоссияMinistry of Healthcare of the Irkutsk RegionRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Иркутской областиРоссияDepartment of Russian Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing in the Irkutsk RegionRussian Federation202228062022724555Copyright © Ботвинкин А.Д., Кравченко Н.А., Баянова Т.А., Хакимова М.И., Гаврилова Т.А., Лиханова Н.А., 20222022Ботвинкин А.Д., Кравченко Н.А., Баянова Т.А., Хакимова М.И., Гаврилова Т.А., Лиханова Н.А.Botvinkin A.D., Kravchenko N.A., Bayanova T.A., Khakimova M.I., Gavrilova T.A., Likhanova N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/548Цель

Цель. Рассчитать эпидемические пороги инцидентности внебольничной пневмонии (ВП) по данным регионального мониторинга и оценить возможность их использования для выявления аномалий внутригодовой динамики заболеваемости.

Материалы и методы

Материалы и методы. Проведено «срезовое» эпидемиологическое исследование по материалам санитарно-эпидемиологической службы Иркутской области за 2013−2020 гг. Для расчета эпидемических порогов использовали сведения за 2013−2018 гг. о впервые выявленных случаях заболевания ВП по календарным неделям. Аналогичные данные за 2019 и 2020 гг. использовали для ретроспективного сопоставления с пороговыми показателями.

Результаты

Результаты. В статье описан оригинальный подход к расчету эпидемических порогов впервые выявленной заболеваемости по данным мониторинга ВП, который после 2011 г. проводится во всех субъектах Российской Федерации. Определение эпидемических порогов инцидентности ВП основано на расчете медианы и квартилей (Q3 и Q1) по календарным неделям и интервалам в 4 недели, дифференцированно для совокупного населения, детей (0–17 лет), взрослых трудоспособного возраста (18–64 года) и пенсионеров (65 лет и более) в показателях на 100000 населения. При сравнении с верхним эпидемическим порогом (Q3) выявлены изменения в сезонной динамике заболеваемости ВП в 2019 и 2020 гг., ассоциированные с распространением гриппа, COVID-19, и эпидемией не установленной точно этиологии, преимущественно среди детей.

Заключение

Заключение. Методика расчета эпидемических порогов заболеваемости ВП может быть использована в работе санитарно-эпидемиологической службы, в том числе при проведении синдромного надзора за эмерджентными инфекциями.

Aim

Aim. To calculate epidemic incidence thresholds for community-acquired pneumonia in the Irkutsk Region and to identify irregularities in the annual incidence trends.

Materials and Methods

Materials and Methods. We carried out a cross-sectional epidemiological study evaluating the relevant data from the Irkutsk Region during 2013-2020. To calculate the epidemic thresholds, we used weekly information for 2013-2018 about newly diagnosed cases of community-acquired pneumonia. Similar data for 2019 and 2020 were used for retrospective comparison with the calculated thresholds.

Results

Results. Computation of the community-acquired pneumonia epidemic incidence thresholds is based on the weekly and 4-week calculation of the median and quartiles (Q1 ; Q3 ), which is conducted differentially for the total population, children (≤ 17 years of age), working adults (18-64 years of age) and pensioners (≥ 65 years of age) per 100,000 population. When compared with the upper epidemic threshold (Q3 ), seasonal changes in the incidence of community-acquired pneumonia have been revealed in 2019 and 2020; they were associated with the spread of infuenza, COVID-19, and an epidemic of unknown origin which was observed mostly among children.

Conclusion

Conclusion. Calculation of epidemic thresholds for the incidence of community-acquired pneumonia can be used in epidemiological surveillance.

внебольничная пневмонияинцидентностьэпидемические порогиретроспективный анализcommunity-acquired pneumoniaincidenceepidemic thresholdretrospective analysisReferencesПопова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Омариев З.М. Эпидемиология и профилактика внебольничных пневмоний. Инфекционные болезни: Новости, Мнения, Обучение. 2019;8(2(29)):43-48. https://doi.org/10.24411/2305-3496-2019-12005Popova AYu, Yezhlova EB, Demina YuV, Omariyev ZM. Epidemiology and prevention of community-acquired pneumonia. Infectious Diseases. News, Opinions, Trainings. 2019; (2(29)):43. (In Russ). https://doi.org/10.24411/2305-3496-2019-12005О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2020 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2021. Ссылка активна на 15.03.2022. https://rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=18266O sostoyanii sanitarno-epidemiologicheskogo blagopoluchiya naseleniya v Rossiyskoy Federatsii v 2020 godu: Gosudarstvennyy doklad. Moscow: Federal'naya sluzhba po nadzoru v sfere zashchity prav potrebiteley i blagopoluchiya cheloveka, 2021. (In Russ). Available in: https://rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=18266 Accessed: 16 March, 2022.Биличенко Т.Н., Чучалин А.Г. Заболеваемость и смертность населения России от острых респираторных вирусных инфекций, пневмонии и вакцинопрофилактика. Терапевтический архив. 2018;1:22-28. https://doi.org/10.26442/terarkh201890122-26Bilichenko TN, Chuchalin AG. Morbidity and mortality of the Russian population from acute respiratory viral infections, pneumonia and vaccination. Terapevticheskii Arkhiv. 2018;90(1):22-28. (In Russ). https://doi.org/10.26442/terarkh201890122-26Груздева О.А., Биличенко Т.Н., Воронцова В.А., Уварова А.В. Заболеваемость гриппом, острыми респираторными вирусными инфекциями и пневмонией населения Центрального административного округа г. Москвы и вакцинопрофилактика в 2012-2016 гг. Пульмонология. 2017;27(6):732-739. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2017-27-6-732-739Gruzdeva OA, Bilichenko TN, Vorontsova VA, Uvarova A.V. Morbidity of infuenza, other acute respiratory viral infections and pneumonia in population of the central district of Moscow, 2012 - 2016, and vaccine prevention. Pulmonology. 2017;27(6):732-739. (In Russ). https://doi.org/10.18093/0869-0189-2017-27-6-732-739Даниленко Д.М., Соминина А.А., Комиссаров А.Б., Писарева М.М., Столяров К.А., Мусаева Т.Д., Едер В., Бакаев М.И., Комиссарова К.С., Иванова А.А., Фадеев А.В., Смородинцева Е.А., Рожкова Е.Г., Гужов Д.А., Венев Е.В., Дондурей Е.А., Афанасьева О.И., Образцова Е.В., Тимонина В.С., Головачева Е.Г., Курская О.Г., Шестопалов А.М., Алимов А.В., Леленкова Е.В., Лиознов Д.А. Этиология тяжелой острой респираторной вирусной инфекции в эпидемические сезоны 2015-2020 гг. Терапия. 2021;7(4(46)):7-17. https://doi.org/10.18565/Therapy/2021.4.7-17Danilenko DM, Sominina AA, Komissarov AB, Pisareva MM, Stolyarov KA, Musayeva TD, Yeder V, Bakayev MI, Komissarova KS, Ivanova AA, FadeyevAV, Smorodintseva EA, Rozhkova EG, Guzhov DA, Venev EV, Dondurey EA, Afanas'yeva OI, Obraztsova EV, Timonina VS, Golovacheva EG, Kurskaya OG, Shestopalov AM, Alimov AV, Lelenkova EV, Lioznov DA. Etiology of severe acute respiratory viral infection during the epidemic seasons 2015-2020. Therapy. 2021;7(4(46)):7-17. (In Russ). https://doi.org/10.18565/Therapy/2021.4.7-17Смирнова С.С., Леленкова Е.В., Маркарян А.Ю., Вялых И.В., Алимов А.В. Клинико-эпидемиологическая и этиологическая характеристика тяжелых острых респираторных инфекций у госпитализированных пациентов. Инфекционные болезни. 2021;19(1):64-70. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2021-1-64-70Smirnova SS, Lelenkova YeV, Markaryan AYu, Vyalykh IV, Alimov AV. Clinical, epidemiological and etiological features of severe acute respiratory infections in hospitalized patients. Infectious Diseases. 2021;19(1):64-70. (In Russ). https://doi.org/10.20953/1729-9225-2021-1-64-70Lazarus R, Kleinman KP, Dashevsky I, DeMaria A, Platt R. Using automated medical records for rapid identifcation of illness syndromes (syndromic surveillance): the example of lower respiratory infection. BMC Public Health. 2001;1(9). https://doi.org/10.1186/1471-2458-1-9Lazarus R, Kleinman KP, Dashevsky I, DeMaria A, Platt R. Using automated medical records for rapid identifcation of illness syndromes (syndromic surveillance): the example of lower respiratory infection. BMC Public Health. 2001;1:9. https://doi.org/10.1186/1471-2458-1-9Онищенко Г.Г., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В. Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями как одно из направлений биологической безопасности. Проблемы особо опасных инфекций. 2013;4:24-27.Onishchenko GG, Yezhlova EB, Demina YuV. Epidemiological surveillance over community-acquired pneumonia as one of the means for biological safety provision. Epidemiological surveillance of community-acquired pneumonia as one of the areas of biological safety. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2013;4:24-27. (In Russ).Xiang N, Song Y, Wang Y, Wu J, Millman AJ, Greene CM, Ding Z, Sun J, Yang W, Guo G, Wang R, Guo P, Ren Z, Gong L, Xu P, Zhou S, Lin D, Ni D, Feng Z, Li Q. Lessons from an active surveillance pilot to assess the pneumonia of unknown etiology surveillance system in China, 2016: the need to increase clinician participation in the detection and reporting of emerging respiratory infectious diseases. BMC Infect Dis. 2019;19(1):770. https://doi.org/10.1186/s12879-019-4345-0Xiang N, Song Y, Wang Y, Wu J, Millman AJ, Greene CM, Ding Z, Sun J, Yang W, Guo G, Wang R, Guo P, Ren Z, Gong L, Xu P, Zhou S, Lin D, Ni D, Feng Z, Li Q. Lessons from an active surveillance pilot to assess the pneumonia of unknown etiology surveillance system in China, 2016: the need to increase clinician participation in the detection and reporting of emerging respiratory infectious diseases. BMC Infect Dis. 2019;19(1):770. https://doi.org/10.1186/s12879-019-4345-0Zhu H, Wang Q, Zhang T, Liu X, Dai R, Wu P, Bai G, Wang Y, Zhou P, Luo L. Initial public-health emergency response to SARS and COVID-19 pandemics in Mainland China: A retrospective comparative study. Risk Manag Health Policy. 2021;14:4199-4209. https://doi.org/10.2147/RMHP.S324431Zhu H, Wang Q, Zhang T, Liu X, Dai R, Wu P, Bai G, Wang Y, Zhou P, Luo L. Initial public-health emergency response to SARS and COVID-19 pandemics in Mainland China: A retrospective comparative study. Risk Manag Healthc Policy. 2021;14:4199-4209. https://doi.org/10.2147/RMHP.S324431Соминина А.А., Смородинцева Е.А., Столяров К.А., Мельникова А.А. Совершенствование системы надзора за гриппом в Российской Федерации: основные результаты сигнального надзора за гриппом и другими острыми респираторными вирусными инфекциями. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2017;16(1):7-15. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-1-7-15Sominina AA, Smorodintseva EA, Stolyarov KA, Mel'nikova AA. Enhancement of the infuenza Surveillance System in the Russian Federation: the Main Results of the Sentinel Surveillance for Infuenza and other Acute Respiratory Viral Infections. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2017;16(1):7-15. (In Russ). https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-1-7-15Карпова Л.С., Соминина А.А., Даниленко Д.М., Волик К.М., Леоненко В.Н. Оценка эффективности базовых линий и порогов интенсивности эпидемий по результатам традиционного надзора за гриппом. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2019;18(4):4- 13. https://10.31631/2073-3046-2019-18-4-4-13Karpova LS, Sominina AA, Danilenko DM, Volik KM, Leonenko V.N. Evaluation of the Effectiveness of Baselines and Thresholds Intensity Epidemics, According to the Results of Traditional Surveillance for Infuenza. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2019;18(4):4-13. (In Russ). https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-4-4-13Vega T, Lozano JE, Meerhoff T, Snacken R, Beauté J, Jorgensen P, Ortiz de Lejarazu R, Domegan L, Mossong J, Nielsen J, Born R, Larrauri A, Brown C. Infuenza surveillance in Europe: comparing intensity levels calculated using the moving epidemic method. Infuenza Other Respir Viruses. 2015;9(5):234-246. https://doi.org/10.1111/irv.12330Vega T, Lozano JE, Meerhoff T, Snacken R, Beauté J, Jorgensen P, Ortiz de Lejarazu R, Domegan L, Mossong J, Nielsen J, Born R, Larrauri A, Brown C. Infuenza surveillance in Europe: comparing intensity levels calculated using the moving epidemic method. Infuenza Other Respir Viruses. 2015;9(5):234-246. https://doi.org/10.1111/irv.12330Методика расчета эпидемических порогов по гриппу и острым респираторным вирусным инфекциям по субъектам Российской Федерации. МР 3.1.2.0118-17. Ссылка активна на 15.03.2022 г. https://docs.cntd.ru/document/555652160Metodika rascheta epidemicheskikh porogov po grippu i ostrym respiratornym virusnym infektsiyam po sub"ektam Rossiyskoy Federatsii. MR 3.1.2.0118-17. (In Russ). Available at: https://docs.cntd.ru/document/555652160 Accessed: 16 March, 2022.Кравченко Н.А., Гаврилова Т.А., Хакимова М.И., Казанова В.Б., Васильева Е.И., Ботвинкин А.Д. Опыт сравнительного анализа заболеваемости пневмониями и острыми респираторными инфекциями верхних дыхательных путей после внедрения системы эпидемиологического мониторинга пневмоний. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019;18(1):96-104. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-1-96-104Kravchenko NA, Gavrilova TA, Khakimova MI, Kazanova VB, Vasilyeva EI, Botvinkin AD. The Experience of a Comparative Analysis of the Incidence of Pneumonia and Acute Respiratory Infections of the Upper Respiratory Tract after the Introduction of a System of Epidemiological Monitoring of Pneumonia. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2019;18(1):96-104. (In Russ). https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-1-96-104Кузовникова Е.Ж., Девятков М.Ю., Сергевнин В.И., Овчинников К.В. Эпидемиологические проявления заболеваемости внебольничной пневмонией за период с момента введения официальной регистрации случаев. Санитарный врач. 2019;(10):15-20.Kuzovnikova EZh, Devyatkov MYu, Sergevnin VI, Ovchinnikov KV. Epidemiological manifestations related to the incidence of communityacquired pneumonia since the start of offcial registration of cases. Sanitarnyy vrach. 2019;10:15-20. (In Russ).Блох А.И., Пеньевская Н.А., Рудаков Н.В., Лазарев И.И. Эпидемический потенциал COVID-19 в Омской области и оценка возможного влияния противоэпидемических мероприятий. Фундаментальная и клиническая медицина. 2020;5(3):8-17. https://doi.org/10.23946/2500-0764-2020-5-3-8-17Blokh AI, Pen'yevskaya NA, Rudakov NV, Lazarev II. Epidemic potential of COVID-19 in Omsk region and assessment of theantiepidemic measures. Fundamental and Clinical Medicine. 2020;5(3):8-17. (In Russ). https://doi.org/10.23946/2500-0764-2020-5-3-8-17ВОЗ. Эпидемиологический надзор за COVID-19. Временные рекомендации от 14 февраля 2022 г. Ссылка активна на 15.03.222 г. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/352033/WHO2019-nCoV-Surveillance-Guidance-2022.1-rus.pdf?sequence=1&isAllowed=yWHO. Epidemiological surveillance of COVID-19. Interim guidance dated February 14, 2022. (In Russ). Available in: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/352033/WHO-2019-nCoV-SurveillanceGuidance-2022.1-rus.pdf?sequence=1&isAllowed=y Accessed: 15 March 2022.Жильцов И.В., Семенов В.М., Зенькова С.К. Основы медицинской статистики. Дизайн биомедицинских исследований. Практическое руководство. Витебск: ВГМУ, 2014. 154 с.Zhiltsov IV, Semenov VM, Zenkova SK. Fundamentals of medical statistics. Biomedical research design. Practical guide. Vitebsk: VSMU; 2014. 154 pp. (In Russ).О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Иркутской области в 2019 году: Государственный доклад. Иркутск: 2020. Ссылка активна на 15.03.2022 http://38.rospotrebnadzor.ru/c/document_library/get_file?uuid=d8c9d2b4-8d86-4691-ac69-e8c1ae0af5bf&groupId=130642On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Irkutsk region in 2019: State report. Irkutsk: 2020. (In Russ). Available in: http://38.rospotrebnadzor.ru/c/document_library/get_fle?uuid=d8c9d2b4-8d86-4691-ac69-e8c1ae0af5bf&groupId=130642 Accessed: 15 March 2022.Бриткова Т.А., Гудовских Н.В., Чупина М.С. Сравнительная характеристика типичной и атипичной (микоплазменной) пневмонии у детей. Детские инфекции. 2021;20(2):57-59. https://doi.org/10.22627/2072-8107-2021-20-2-57-59Britkova TA, Gudovskikh NV, Chupina MS. Comparative characteristics of typical and atypical (mycoplasma) pneumonia in children. Children Infections. 2021;20(2):57-59. (In Russ). https://doi.org/10.22627/2072-8107-2021-20-2-57-59Балахонов С.В., Дубровина В.И., Пятидесятникова А.Б., Брюхва Д.Д., Киселева Н.О., Корытов К.М., Войткова В.В., Пережогин А.Н., Чеснокова М.В., Гаврилова Т.А., Селедцов А.А. Динамика изменений популяционного иммунитета к вирусу SARS-CоV-2 у жителей Иркутской области в условиях пандемии COVID-19. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021;20(2):12-17. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-2-12-17Balakhonov SV, Dubrovina VI, Pyatidesyatnikova AB, Briukhova DD, Kiseleva NO, Korytov KM, Voitkova VV, Perezhogin AN, Chesnokova MV, Gavrilova TA, Seledtcov AA. Dynamics of changes in population immunity to the SARS-CоV-2 virus in residents the Irkutsk region in the context of the COVID-19 pandemic. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2021;20(2):12-17. (In Russ). https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-2-12-17

The authors declare that there are no conflicts of interest present.