<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">fcmedicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фундаментальная и клиническая медицина</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Fundamental and Clinical Medicine</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2500-0764</issn><issn pub-type="epub">2542-0941</issn><publisher><publisher-name>КемГМУ</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.23946/2500-0764-2022-7-2-94-101</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">fcmedicine-553</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>REVIEW ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Анализ геномов Coxiella burnetii при изучении эпидемии лихорадки Ку</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Analysis of Coxiella burnetii genomes in context of epidemic Q fever</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4550-3459</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шпынов</surname><given-names>С. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shpynov</surname><given-names>S. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Шпынов Станислав Николаевич, доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</p><p>644080, г. Омск, пр-т Мира, д. 7,</p><p>644099, г. Омск, ул. Ленина, д. 12</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Prof. Stanislav N. Shpynov, MD, DSc, Chief Researcher, Laboratory of Zoonotic Infections, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections; Professor, Department of Microbiology, Virology and Immunology, Omsk State Medical University</p><p>7, Mira Prospekt, Omsk, 644080, </p><p>12, Lenina Street, Omsk</p></bio><email xlink:type="simple">stan63@inbox.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9566-9214</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рудаков</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rudakov</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Рудаков Николай Викторович, доктор медицинских наук, профессор, директор ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, заведующий кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</p><p>644080, г. Омск, пр-т Мира, д. 7,</p><p>644099, г. Омск, ул. Ленина, д. 12</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Prof. Nikolay V. Rudakov, MD, DSc, Chief Executive Offcer, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections; Head of the Department of Microbiology, Virology and Immunology, Omsk State Medical University</p><p>7, Mira Prospekt, Omsk, 644080, </p><p>12, Lenina Street, Omsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8284-1684</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Зеликман</surname><given-names>С. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zelikman</surname><given-names>S. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Зеликман Светлана Юрьевна, младший научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций ФБУН «Омский научноисследовательский институт природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, ассистент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</p><p>644080, г. Омск, пр-т Мира, д. 7,</p><p>644099, г. Омск, ул. Ленина, д. 12</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Dr. Svetlana Yu. Zelikman, Junior Research Fellow, Laboratory of Zoonotic Infections, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections; Assistant Professor, Department of Microbiology, Virology and Immunology, Omsk State Medical University</p><p>7, Mira Prospekt, Omsk, 644080, </p><p>12, Lenina Street, Omsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4896-9369</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Транквилевский</surname><given-names>Д. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Trankvilevskiy</surname><given-names>D. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Транквилевский Дмитрий Валерьевич, зоолог</p><p>117105, г. Москва, Варшавское шоссе, д. 19а</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Dr. Dmitriy V. Trankvilevskiy, Zoologist</p><p>19a, Varshavskoe Highway, Moscow</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора;&#13;
ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Минздрава России</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Omsk Research Institute of Natural Focal Infections;&#13;
Omsk State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии» Роспотребнадзора</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal Hygiene and Epidemiology Center</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>28</day><month>06</month><year>2022</year></pub-date><volume>7</volume><issue>2</issue><fpage>94</fpage><lpage>101</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Шпынов С.Н., Рудаков Н.В., Зеликман С.Ю., Транквилевский Д.В., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Шпынов С.Н., Рудаков Н.В., Зеликман С.Ю., Транквилевский Д.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Shpynov S.N., Rudakov N.V., Zelikman S.Y., Trankvilevskiy D.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/553">https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/553</self-uri><abstract><p>Лихорадка Ку – зоонозная инфекция, вызываемая Coxiella burnetii. Основными источниками заражения человека является больной скот (козы, овцы и коровы), сырье и мясомолочное продукты переработки, предметы ухода за животными и другие объекты, инфицированные коксиеллами. Особое значение при лихорадке Ку, с учетом высокой устойчивости возбудителя, имеет «пылевая инфекция». C. burnetii считается агентом биологического оружия, применение его в виде аэрозоля вызывает острые заболевания с дальнейшей инвалидизацией. Хронизация инфекции может вызывать эндокардит, приводящий к фатальным последствиям, или синдрому хронической усталости. В Нидерландах с 2007 по 2010 гг. был выявлен высокий рост заболеваемости лихорадкой Ку у людей (более 4000 случаев острой формы). Большинство случаев заболевания было связано с козьими фермами. Анализ десяти полноразмерных аннотированных геномов штаммов C. burnetii позволил провести молекулярно-эпидемиологический скрининг кодирующих и некодирующих структур этих геномов с целью изучить возможное происхождение штаммов, вызвавших заболевания. Использование формального анализа строя помогло более углубленно проанализировать геномы штаммов коксиелл и дифференцировать их на шесть групп. Было показано, что штаммы Z3055 (абортированная плацента овцы, Германия) и NL3262 (абортированная плацента козы, Нидерланды) являются наиболее близкими и содержат 84,9% компонентов хромосом с полной гомологией. Ведущим мотивом в реорганизации генома C. burnetii является адаптация штамма этого микроорганизма к «новому» виду хозяина. Самая крупная из известных эпидемий лихорадки Ку могла произойти при снижении качества ветеринарного надзора, в результате чего возникли условия для реализации эпизоотологического процесса, что способствовало появлению очагов коксиеллёза с дальнейшей реализацией эпидемического процесса в отношении персонала, обслуживающего фермы по производству козьего сыра. Переход «овечьего» (Z3055-подобного) штамма к «козьему» (NL3262) при «смене» хозяина в результате эпизоотологического процесса мог поспособствовать осложнению эпидемической ситуации при лихорадке Ку. </p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Q fever is a zoonotic infection caused by Coxiella burnetii. Infected goats, sheep and cattle, materials of animal origin, meat and dairy products are the main sources of C. burnetii for humans. Dust C. burnetii infection is of particular importance due to the high resistance of this pathogen. C. burnetii is considered as a biological weapon and its use as an aerosol causes acute diseases with further disability. Chronic C. burnetii infection can cause endocarditis, leading to a chronic fatigue syndrome or even death. In the Netherlands, a pronounced increase in the incidence of Q fever in humans was detected from 2007 to 2010 (≥ 4,000 acute cases), mostly associated with goat farms. Analysis of 10 C. burnetii genomes allowed molecular epidemiology screening of coding and non-coding structures for studding the possible origin of the outbreak strains. Strains Z3055 (sheep placenta, Germany) and NL3262 (goat placenta, Netherlands) are the most closely related (84.9% homologous sequence). Formal order analysis distinguished 6 groups of C. burnetii strains. Adaptation to a new host emerged as a driving force for the reorganization of C. burnetii genome. The largest epidemic of Q fever could occur because of an inadequate veterinary supervision that led to the epizootic and further epidemic in the farmers producing the goat cheese. The transition of the «sheep» (Z3055-like) strain to the «goat» (NL3262) strains, characterised by a change of the host during the epizootic, could signifcantly contribute to the severity of that Q fever epidemic.</p><p> </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>лихорадка Ку</kwd><kwd>Coxiella burnetii</kwd><kwd>геном</kwd><kwd>эпидемия</kwd><kwd>биологическое оружие</kwd><kwd>мелкий рогатый скот</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Q fever</kwd><kwd>Coxiella burnetii</kwd><kwd>genome</kwd><kwd>epidemic</kwd><kwd>biological weapon</kwd><kwd>small cattle</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Егембердиева Р.А., Дуйсенова А.К., Сейдулаева Л.Б. Клещевые трансмиссивные инфекции человека. Омск : ООО ИЦ «Омский научный вестник»; 2016.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Egemberdieva RA, Duysenova AK, Seydulaeva LB. Kleshchevye transmissivnye infektsii cheloveka. Omsk : OOO ITs Omskiy nauchnyy vestnik; 2016. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Фетисова Н.Ф., Сыскова Т.Г. Коксиеллез в Российской Федерации. Здоровье населения и среда обитания – ЗНИСО. 1994;2:10-12.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov NV, Fetisova NF, Syskova TG. Koksiellez v Rossiyskoy Federatsii. Public Health and Life Environment - PH&amp;LE. 1994;2:10- 12. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kuley R, Kuijt E, Smits MA, Roest HIJ, Smith HE, Bossers A. Genome Plasticity and Polymorphisms in Critical Genes Correlate with Increased Virulence of Dutch Outbreak-Related Coxiella burnetii Strains. Front Microbiol. 2017;8:1526. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01526</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuley R, Kuijt E, Smits MA, Roest HIJ, Smith HE, Bossers A. Genome Plasticity and Polymorphisms in Critical Genes Correlate with Increased Virulence of Dutch Outbreak-Related Coxiella burnetii Strains. Front Microbiol. 2017;8:1526. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01526</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mori M, Boarbi S, Michel P, Bakinahe R, Rits K, Wattiau P, Fretin D. In vitro and in vivo infectious potential of coxiella burnetii: a study on Belgian livestock isolates. PLoS One. 2013;8(6):e67622. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0067622</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mori M, Boarbi S, Michel P, Bakinahe R, Rits K, Wattiau P, Fretin D. In vitro and in vivo infectious potential of coxiella burnetii: a study on Belgian livestock isolates. PLoS One. 2013;8(6):e67622. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0067622</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Roest HI, Ruuls RC, Tilburg JJ, Nabuurs-Franssen MH, Klaassen CH, Vellema P, van den Brom R, Dercksen D, Wouda W, Spierenburg MA, van der Spek AN, Buijs R, de Boer AG, Willemsen PT, van Zijderveld FG. Molecular epidemiology of Coxiella burnetii from ruminants in Q fever outbreak, the Netherlands. Emerg Infect Dis. 2011;17(4):668- 675. https://doi.org/10.3201/eid1704.101562</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Roest HI, Ruuls RC, Tilburg JJ, Nabuurs-Franssen MH, Klaassen CH, Vellema P, van den Brom R, Dercksen D, Wouda W, Spierenburg MA, van der Spek AN, Buijs R, de Boer AG, Willemsen PT, van Zijderveld FG. Molecular epidemiology of Coxiella burnetii from ruminants in Q fever outbreak, the Netherlands. Emerg Infect Dis. 2011;17(4):668- 675. https://doi.org/10.3201/eid1704.101562</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tilburg JJ, Roest HJ, Buffet S, Nabuurs-Franssen MH, Horrevorts AM, Raoult D, Klaassen CH. Epidemic genotype of Coxiella burnetii among goats, sheep, and humans in the Netherlands. Emerg Infect Dis. 2012;18(5):887-889. https://doi.org/10.3201/eid1805.111907</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tilburg JJ, Roest HJ, Buffet S, Nabuurs-Franssen MH, Horrevorts AM, Raoult D, Klaassen CH. Epidemic genotype of Coxiella burnetii among goats, sheep, and humans in the Netherlands. Emerg Infect Dis. 2012;18(5):887-889. https://doi.org/10.3201/eid1805.111907</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Кучерук В.В. Природная очаговость инфекций – основные термины и понятия. В кн.: Избранные труды по природной очаговости болезней. Москва: РУСАКИ; 2006:272-281.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kucheruk VV. Prirodnaya ochagovost' infektsiy – osnovnye terminy i ponyatiya. In: Izbrannye trudy po prirodnoy ochagovosti bolezney. Moscow: RUSAKI; 2006:272-281. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Дайтер А.Б., Рыбакова Н.А., Токаревич Н.К., Самитова В.И., Лимин Б.В. Эпидемиологическая проекция внутристадных очагов лихорадки Ку. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1988:65(11):51-56.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Dayter AB, Rybakova NA, Tokarevich NK, Samitova VI, Limin BV. Epidemiologicheskaya proektsiya vnutristadnykh ochagov likhoradki Ku. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 1988:65(11):51-56. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Madariaga MG, Rezai K, Trenholme GM, Weinstein RA. Q fever: a biological weapon in your backyard. Lancet Infect Dis. 2003;3(11):709- 721. https://doi.org/10.1016/s1473-3099(03)00804-1.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Madariaga MG, Rezai K, Trenholme GM, Weinstein RA. Q fever: a biological weapon in your backyard. Lancet Infect Dis. 2003;3(11):709- 721. https://doi.org/10.1016/s1473-3099(03)00804-1.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Maurin M, Raoult D. Q fever. Clin Microbiol Rev. 1999;12(4):518- 553. https://doi.org/10.1128/CMR.12.4.518</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Maurin M, Raoult D. Q fever. Clin Microbiol Rev. 1999;12(4):518- 553. https://doi.org/10.1128/CMR.12.4.518</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tissot-Dupont H, Raoult D. Q fever. Infect Dis Clin North Am. 2008;22(3):505-514. https://doi.org/10.1016/j.idc.2008.03.002</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tissot-Dupont H, Raoult D. Q fever. Infect Dis Clin North Am. 2008;22(3):505-514. https://doi.org/10.1016/j.idc.2008.03.002</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Davis GE, Cox HR. A flter-passing Infectious Agent isolated from Ticks. I. Isolation from Dermacentor andersoni, Reactions in Animals, and Filtration Experiments. Public Health Reports. 1938;53:2259.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Davis GE, Cox HR. A flter-passing Infectious Agent isolated from Ticks. I. Isolation from Dermacentor andersoni, Reactions in Animals, and Filtration Experiments. Public Health Reports. 1938;53:2259.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Здродовский П.Ф., Голиневич Е.М. Учение о риккетсиях и риккетсиозах. Москва: Медицина; 1972.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zdrodovskiy PF, Golinevich EM. Uchenie o rikketsiyakh i rikketsiozakh. Mosсow: Medicine; 1972. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kuley R, Smith HE, Janse I, Harders FL, Baas F, Schijlen E, NabuursFranssen MH, Smits MA, Roest HI, Bossers A. First Complete Genome Sequence of the Dutch Veterinary Coxiella burnetii Strain NL3262, Originating from the Largest Global Q Fever Outbreak, and Draft Genome Sequence of Its Epidemiologically Linked Chronic Human Isolate NLhu3345937. Genome Announc. 2016;4(2):e00245. https://doi.org/16.10.1128/genomeA.00245-16</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuley R, Smith HE, Janse I, Harders FL, Baas F, Schijlen E, NabuursFranssen MH, Smits MA, Roest HI, Bossers A. First Complete Genome Sequence of the Dutch Veterinary Coxiella burnetii Strain NL3262, Originating from the Largest Global Q Fever Outbreak, and Draft Genome Sequence of Its Epidemiologically Linked Chronic Human Isolate NLhu3345937. Genome Announc. 2016;4(2):e00245. https://doi.org/16.10.1128/genomeA.00245-16</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ladbury GA, Van Leuken JP, Swart A, Vellema P, Schimmer B, Ter Schegget R, Van der Hoek W. Integrating interdisciplinary methodologies for One Health: goat farm re-implicated as the probable source of an urban Q fever outbreak, the Netherlands, 2009. BMC Infect Dis. 2015;15:372. https://doi.org/10.1186/s12879-015-1083-9</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ladbury GA, Van Leuken JP, Swart A, Vellema P, Schimmer B, Ter Schegget R, Van der Hoek W. Integrating interdisciplinary methodologies for One Health: goat farm re-implicated as the probable source of an urban Q fever outbreak, the Netherlands, 2009. BMC Infect Dis. 2015;15:372. https://doi.org/10.1186/s12879-015-1083-9</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Roest HJ, van Gelderen B, Dinkla A, Frangoulidis D, van Zijderveld F, Rebel J, van Keulen L. Q fever in pregnant goats: pathogenesis and excretion of Coxiella burnetii. PLoS One. 2012;7(11):e48949. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0048949</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Roest HJ, van Gelderen B, Dinkla A, Frangoulidis D, van Zijderveld F, Rebel J, van Keulen L. Q fever in pregnant goats: pathogenesis and excretion of Coxiella burnetii. PLoS One. 2012;7(11):e48949. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0048949</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">D'Amato F, Rouli L, Edouard S, Tyczka J, Million M, Robert C, Nguyen TT, Raoult D. The genome of Coxiella burnetii Z3055, a clone linked to the Netherlands Q fever outbreaks, provides evidence for the role of drift in the emergence of epidemic clones. Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2014;37(5-6):281-288. https://doi.org/10.1016/j.cimid.2014.08.003</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">D'Amato F, Rouli L, Edouard S, Tyczka J, Million M, Robert C, Nguyen TT, Raoult D. The genome of Coxiella burnetii Z3055, a clone linked to the Netherlands Q fever outbreaks, provides evidence for the role of drift in the emergence of epidemic clones. Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2014;37(5-6):281-288. https://doi.org/10.1016/j.cimid.2014.08.003</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kuley R, Smith HE, Frangoulidis D, Smits MA, Jan Roest HI, Bossers A. Cell-free propagation of Coxiella burnetii does not affect its relative virulence. PLoS One. 2015;10(3):e0121661. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0121661</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuley R, Smith HE, Frangoulidis D, Smits MA, Jan Roest HI, Bossers A. Cell-free propagation of Coxiella burnetii does not affect its relative virulence. PLoS One. 2015;10(3):e0121661. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0121661</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Гуменюк А.С., Поздниченко Н.Н., Родионов И.Н., Шпынов С.Н. О средствах формального анализа строя нуклеотидных цепей. Математическая биология и биоинформатика. 2013;8(1):373-397. https://doi.org/10.17537/2013.8.373</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gumenyuk AS, Pozdnichenko NN, Rodionov IN, Shpynov SN. On the means of formal order analysis of the structure of nucleotide chains. Mathematical biology and bioinformatics. 2013;8(1):373-397. (In Russ). https://doi.org/10.17537/2013.8.373</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shpynov SN, Tarasevich IV, Skiba AA, Pozdnichenko NN, Gumenuk AS. Comparison of genomes of Coxiella burnetii strains using formal order analysis. New Microbes New Infect. 2018;23:86-92. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2018.02.011</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shpynov SN, Tarasevich IV, Skiba AA, Pozdnichenko NN, Gumenuk AS. Comparison of genomes of Coxiella burnetii strains using formal order analysis. New Microbes New Infect. 2018;23:86-92. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2018.02.011.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Fournier P-E. European Society for Coxiellosis, Chlamydioses, Anaplasmoses and Rickettsioses - American Society for Rickettsiology joint meeting 2017. New Microbes New Infect. 2018;23:6. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2018.02.001.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Fournier P-E. European Society for Coxiellosis, Chlamydioses, Anaplasmoses and Rickettsioses - American Society for Rickettsiology joint meeting 2017. New Microbes New Infect. 2018;23:6. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2018.02.001.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
