<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">fcmedicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фундаментальная и клиническая медицина</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Fundamental and Clinical Medicine</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2500-0764</issn><issn pub-type="epub">2542-0941</issn><publisher><publisher-name>КемГМУ</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.23946/2500-0764-2022-7-3-40-45</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">fcmedicine-571</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCH</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Чувствительность к бактериофагам условно-патогенной микробиоты при микроэкологических нарушениях кишечника у детей города Кемерово</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Bacteriophage sensitivity of opportunistic microbiota in children with gut dysbiosis</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5977-9149</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Леванова</surname><given-names>Л. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Levanova</surname><given-names>L. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Леванова Людмила Александровна, доктор медицинских наук, заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии </p><p>650056, г. Кемерово, ул. Ворошилова, д. 22а</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Prof. Lyudmila A. Levanova, MD, DSc, Professor, Head of the Department of Microbiology and Virology, </p><p>22а, Voroshilova Street, Kemerovo, 650056, Russian Federation </p></bio><email xlink:type="simple">miss-levanova@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3475-9125</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Захарова</surname><given-names>Ю. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zakharova</surname><given-names>Yu. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Захарова Юлия Викторовна, доктор медицинских наук, профессор кафедры микробиологии и вирусологии </p><p>650056, г. Кемерово, ул. Ворошилова, д. 22а</p></bio><bio xml:lang="en"><p> Prof. Yuliyа V. Zakharova, MD, DSc, Professor, Department of Microbiology and Virology </p><p>22а, Voroshilova Street, Kemerovo, 650056, Russian Federation </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5001-7068</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Марковская</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Markovskaya</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Марковская Алина Анатольевна, ассистент кафедры эпидемиологии, инфекционных болезней и  дерматовенерологии</p><p>650056, г. Кемерово, ул. Ворошилова, д. 22а</p></bio><bio xml:lang="en"><p> Dr. Alina A. Markovskaya, MD, Assistant Professor, Department of Epidemiology, Infectious Diseases, Dermatology and Venereology </p><p>22а, Voroshilova Street, Kemerovo, 650056, Russian Federation </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4126-4312</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Отдушкина</surname><given-names>Л. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Otdushkina</surname><given-names>L. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Отдушкина Лариса Юрьевна, ассистент кафедры микробиологии и вирусологии </p><p>650056, г. Кемерово, ул. Ворошилова, д. 22а</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Dr. Larisa Yu. Otdushkina, MD, Assistant Professor, Department of Microbiology and Virology </p><p>22а, Voroshilova Street, Kemerovo, 650056, Russian Federation </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Kemerovo State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>30</day><month>09</month><year>2022</year></pub-date><volume>7</volume><issue>3</issue><fpage>40</fpage><lpage>45</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Леванова Л.А., Захарова Ю.В., Марковская А.А., Отдушкина Л.Ю., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Леванова Л.А., Захарова Ю.В., Марковская А.А., Отдушкина Л.Ю.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Levanova L.A., Zakharova Y.V., Markovskaya A.A., Otdushkina L.Y.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/571">https://fcm.kemsmu.ru/jour/article/view/571</self-uri><abstract><p>Высокая специфичность действия бактериофагов, которая носит видовой или штаммовый характер, делает актуальным определение фагочувствительности бактерий в конкретном регионе при различных патологиях и состояниях, в частности при микроэкологических нарушениях.Цель. Изучение литической активности специфических бактериофагов в отношении клебсиелл, протеев и золотистых стафилококков, выделенных из кишечника детей при нарушениях микробиоты.Материалы и методы. Изучали фагочувствительность 315 условно-патогенных микроорганизмов, выделенных из кишечника при микроэкологических нарушениях у 300 детей города Кемерово до 4 лет: 120 штаммов клебсиелл, 70 штаммов протеев и 125 штаммов Staphylococcus aureus. Использовали «Бактериофаг клебсиелл поливалентный очищенный», «Бактериофаг протейный», «Бактериофаг стафилококковый (АО «НПО «Микроген»). Литическую активность бактериофагов изучали капельным методом на среде Мюллера-Хинтона по наличию зоны лизиса бактериальной культуры в месте нанесения бактериофага.Результаты. Установлена низкая чувствительность культур к действию специфических бактериофагов, которые лизировали 37,5% штаммов клебсиелл и 41,4% штаммов протеев. Доля чувствительных к фагу Staphylococcus aureus составила 78,4%. Клебсиеллезный бактериофаг лизировал 56,7% штаммов Klebsiella pneumoniae и 18,3% Klebsiella oxytoca (χ2 =4,71, df=1, p=0,03). Протейный бактериофаг вызывал лизис 52% штаммов Proteus vulgaris и 35,6% Proteus mirabilis (χ2 =5,52, df=1, p=0,04). Установлено снижение литической активности фагов ко всем исследуемым видам условно-патогенных бактерий по мере усугубления дисбиотических нарушений микробиома.Заключение. Микроорганизмы рода Klebsiella и Proteus, выделенные при нарушениях кишечного микробиома, характеризуются низкой чувствительностью к коммерческим бактериофагам.Чувствительность условно-патогенных бактерий к специфическим бактериофагам снижается по мере усугубления микроэкологических нарушений.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Aim. As the activity of bacteriophages is species- and strain-specific, it is necessary to study bacteriophage sensitivity in distinct geographic regions with various disease patterns. Here, we aimed to study the lytic activity of specific commercially available bacteriophages against Klebsiella spp., Proteus spp., and Staphylococcus aureus isolated from the intestines of children with gut dysbiosis.Materials and Methods. Bacteriophage sensitivity was assessed in 315 opportunistic microorganisms (125 Staphylococcus aureus strains, 120 Klebsiella spp. strains, 70 Proteus spp. strains) isolated from the intestinal microbiota of 300 children &lt; 4 years of age with gut dysbiosis. Bacteriophage preparations were produced by Microgen (Russian Federation). The lytic activity of bacteriophages was studied by a drip method on a Muller-Hinton medium by calculating the area of bacterial culture lysis.Results. We found low sensitivity of Klebsiella spp. (37.5% sensitive strains) and Proteus spp. (41.4% sensitive strains) to specific bacteriophages, albeit there were considerable differences between distinct Klebsiella species (Klebsiella pneumoniae, 56.7% sensitive strains; Klebsiella oxytoca, 18.3% sensitive strains, p = 0.03) and Proteus species (Proteus vulgaris, 52.0% strains; Proteus mirabilis, 35.6% strains, p = 0.04). Nevertheless, sensitivity to Staphylococcus aureus was considerably higher (78.4%). In addition, lytic activity of bacteriophages reduced along with the increasing severity of gut dysbiosis.Conclusion. Klebsiella spp. and Proteus spp. isolated from children with dysbiosis have low sensitivity to commercially available bacteriophages. Bacteriophage sensitivity positively correlated with gut dysbiosis.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>бактериофаги</kwd><kwd>условно-патогенные бактерии</kwd><kwd>чувствительность</kwd><kwd>микробиом</kwd><kwd>нарушения</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>bacteriophages</kwd><kwd>opportunistic bacteria</kwd><kwd>sensitivity</kwd><kwd>gut microbiota</kwd><kwd>dysbiosis</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сулейманова З.Я., Устинова Н.В., Турти Т.В. Особенности гастроинтестинальных нарушений у детей с расстройствами аутистического спектра: обзор литературы. Педиатрическая фармакология. 2022;19(2):99-104. http://doi.org/10.15690/pf.v19i2.2397</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Suleymanova ZY, Ustinova NV, Turti TV. Features of gastrointestinal malformations in children with autism spectrum disorders: literature review. Pediatric pharmacology. 2022;19(2):99-104. (In Russ). https://doi.org/10.15690/pf.v19i2.2397</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Червинец В.М., Червинец Ю.В., Кравчук Э.С. Кишечный дисбаланс у молодых людей как маркер хронических соматических заболеваний. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2022;200(4):153-159. https://doi.org/10.31146/1682-8658-ecg-200-4-153-159</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chervinets VM, Chervinets YuV, Kravchuk ES. Intestinal imbalance in young people as a marker of chronic somatic diseases. Experimental and clinical gastroenterology. 2022;200(4):153-159. (In Russ). https://doi.org/10.31146/1682-8658-ecg-200-4-153-159</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Роль микробиоты в регуляции гомеостаза организма человека при инфекции. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020;97(5):456-467. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-5-8</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bukharin OV, Perunova NB. The role of microbiota in the regulation of homeostasis of the human body during infection. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2020;97(5):456-467. (In Russ). https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-5-8</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Grylls A, Seidler K., Neil J. Link between microbiota and hypertension: Focus on LPS/TLR4 pathway in endothelial dysfunction and vascular inflammation, and therapeutic implication of probiotics. Biomed Pharmacother. 2021;137:111334. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2021.111334</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Grylls A, Seidler K, Neil J. Link between microbiota and hypertension: Focus on LPS/TLR4 pathway in endothelial dysfunction and vascular inflammation, and therapeutic implication of probiotics. Biomed Pharmacother. 2021;137:111334. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2021.111334</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Горелов А.В., Мелехина Е.В., Сидельникова Э.С. Профилактика нарушений биоценоза у детей с острыми респираторными инфекциями, получающих антибактериальную терапию. Русский медицинский журнал. 2019;10:26-31</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gorelov AV, Melekhina EV, Sidelnikova ES. Prevention of biocenosis disorders in children with acute respiratory infections receiving antibacterial therapy. Russian Medical Journal. 2019;10: 26-31. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Stewardson AJ, Vervoort J, Adriaenssens N, Coenen S, Godycki-Cwirko M, Kowalczyk A, Huttner BD, Lammens C, Malhotra-Kumar S, Goossens H, Harbarth S; SATURN WP1 Study Group; SATURN WP3 Study Group. Effect of outpatient antibiotics for urinary tract infections on antimicrobial resistance among commensal Enterobacteriaceae: a multinational prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2018;24(9):972-979. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2017.12.026</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stewardson AJ, Vervoort J, Adriaenssens N, Coenen S, Godycki-Cwirko M, Kowalczyk A, Huttner BD, Lammens C, Malhotra-Kumar S, Goossens H, Harbarth S; SATURN WP1 Study Group; SATURN WP3 Study Group. Effect of outpatient antibiotics for urinary tract infections on antimicrobial resistance among commensal Enterobacteriaceae: a multinational prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2018;24(9):972-979. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2017.12.026</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Плотникова Е.Ю., Захарова Ю.В. Антибиотики как модуляторы кишечной микробиоты: между добром и злом. Русский медицинский журнал. 2018;11(II):131-136.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Plotnikova EYu, Zakharova YuV. Antibiotics as modulators of the intestinal microbiota: between good and the bad. Russian Medical Journal. 2018;11(II):131-136. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hsu CL, Duan Y, Fouts DE, Schnab B. Intestinal virome and therapeutic potential of bacteriophages in liver disease. J Hepatol. 2021;75(6):1465-1475. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2021.08.003</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hsu CL, Duan Y, Fouts DE, Schnab B. Intestinal virome and therapeutic potential of bacteriophages in liver disease. J Hepatol. 2021;75(6):1465-1475. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2021.08.003</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shkoporov AN, Hill C. Bacteriophages of the Human Gut: The "Known Unknown" of the Microbiome. Cell Host Microbe. 2019;25(2):195-209. https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.01.017</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shkoporov AN, Hill C. Bacteriophages of the Human Gut: The "Known Unknown" of the Microbiome. Cell Host Microbe. 2019;25(2):195-209. https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.01.017</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mahmoud ERA, Ahmed HAH, Abo-senna ASM, Riad OKM, Rahman Abo- Shadi MM Al. Isolation and characterization of six gamma-irradiated bacteriophages specific for MRSA and VRSA isolated from skin infections. Journal of Radiation Research and Applied Sciences. 2021;14(1):34-43 https://doi.org/10.1080/16878507.2020.1795564</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mahmoud ERA, Ahmed HAH, Abo-senna ASM, Riad OKM, Rahman Abo- Shadi MM Al. Isolation and characterization of six gamma-irradiated bacteriophages specific for MRSA and VRSA isolated from skin infections. Journal of Radiation Research and Applied Sciences. 2021;14(1):34-43 https://doi.org/10.1080/16878507.2020.1795564</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Саперкин Н.В., Ковалишена О.В., Квашнина Д.В., Раузендал Э., Схолтен Р. Эффективность использования бактериофагов для лечения и профилактики инфекции: систематический обзор. Журнал инфектологии. 2019;11(4):19-30. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-4-19-30</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Saperkin NV, Kovalishena OV, Kvashnina DV, Rosenthal E, Scholten R. Efficiency of phage therapy in humans: systematic review. Journal of Infectology. 2019;11(4):19-30. (In Russ). https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-4-19-30</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Асланов Б.И., Зуева Л.П., Долгий А.А., Конев С.Д., Гришко Т.А. Эффективность применения бактериофагов против штаммов Pseudomonas aeruginosa, формирующих микробные биопленки. Профилактическая и клиническая медицина. 2020;77(4):40-45 https://doi.org/10.47843/2074-9120_2020_4_40</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Aslanov BI, Zueva LP, Dolgiy AA, Konev SD, Grishko TA. Efficacy of bacteriophages against Pseudomonas aeruginosa biofilms. Preventive and clinical medicine. 2020;77(4):40-45. (In Russ). https://doi.org/10.47843/2074-9120_2020_4_40</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">ОСТ 91500.11.0004-2003. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника. Введ. 2003-06-09. Москва: Московская медицинская академия имени И.М. Сеченова Минздрава России, 2003. 74 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">OST 91500.11.0004-2003. Protokol vedeniya bol'nykh. Disbakterioz kishechnika. Vved. 2003-06-09. Moscow: Moskovskaya meditsinskaya akademiya imeni I.M. Sechenova Minzdrava Rossii; 2003. 74 p. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике. Федеральные клинические (методические) рекомендации. Москва: 2014. 54 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ratsional'noe primenenie bakteriofagov v lechebnoy i protivoepidemicheskoy praktike. Federal'nye klinicheskie (metodicheskie) rekomendatsii. Moscow: 2014. 54 p. (In Russ).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Захарова Ю.В., Леванова Л.А., Штернис Т.А., Сухих А.С., Марковская А.А. Характеристика биологических свойств бифидобактерий при микроэкологических нарушениях кишечника у ВИЧ-инфицированных детей. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019;3:3-9. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-3-3-9</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zakharova YuV, Levanova LA, Shternis TA, Sukhih AS, Markovskaya AA. Characteristics of bifidobacteria biological properties in gut microflora disorders in hiv-infected children. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology.2019;3:3-9. (In Russ). https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-3-3-9</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Booth SC, Rice SA. Influence of interspecies interactions on the spatial organization of dual species bacterial communities. Biofilm. 2020;2:100035. https://doi.org/10.1016/j.bioflm.2020.100035.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Booth SC, Rice SA. Influence of interspecies interactions on the spatial organization of dual species bacterial communities. Biofilm. 2020;2:100035. https://doi.org/10.1016/j.bioflm.2020.100035.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
