Заболевания репродуктивной системы занимают лидирующие позиции в современной гинекологии. В данном аналитическом обзоре представлена последняя информация о молекулярно-генетических характеристиках эндометрия, а также освещён одни из основных аспектов патогенеза инфертильности при эндометриозе. Актуальность проблемы определяется тем, что на настоящий момент не существует единых диагностических критериев определения рецептивности эндометрия, изменение которой играет одну из ведущих ролей в имплантационных нарушениях. Вполне вероятно, что это связано с индивидуальными особенностями организма каждой женщины, что, в свою очередь, не позволяет привести множество изученных факторов к единому знаменателю. В мировой литературе опубликовано множество статей по изучению экспрессии генов при эндометриозе. Известно, что при возникновении мутации в отдельном гене его функция может выполняться в полном объёме благодаря компенсаторным механизмам. Подобная компенсация обеспечивается работой каскадов белок-белковых взаимодействий, которые осуществляют передачу внутриклеточного сигнала. Выявлено, что степень активации сигнальных путей именно внутри клетки является более качественным маркёром патологического процесса, нежели такой маркёр, как экспрессия генов. Сравнение эутопического и эктопического эндометрия по различным параметрам является одним из направлений современных исследований в области изучения эндометриоза. Несмотря на то, что образцы эндометрия данных локализаций схожи по морфологическим признакам, это не привело к созданию единого диагностического теста. В связи с этим актуальным является поиск новых, статистически обоснованных критериев ранней диагностики инфертильности при эндометриозе с применением малоинвазивных или неинвазивных методов обследования, которые позволили бы также улучшить качество прогнозирования эндометриоз-ассоциированного бесплодия.