Чувствительность к бактериофагам условно-патогенной микробиоты при микроэкологических нарушениях кишечника у детей города Кемерово

Высокая специфичность действия бактериофагов, которая носит видовой или штаммовый характер, делает актуальным определение фагочувствительности бактерий в конкретном регионе при различных патологиях и состояниях, в частности при микроэкологических нарушениях.
Цель. Изучение литической активности специфических бактериофагов в отношении клебсиелл, протеев и золотистых стафилококков, выделенных из кишечника детей при нарушениях микробиоты.
Материалы и методы. Изучали фагочувствительность 315 условно-патогенных микроорганизмов, выделенных из кишечника при микроэкологических нарушениях у 300 детей города Кемерово до 4 лет: 120 штаммов клебсиелл, 70 штаммов протеев и 125 штаммов Staphylococcus aureus. Использовали «Бактериофаг клебсиелл поливалентный очищенный», «Бактериофаг протейный», «Бактериофаг стафилококковый (АО «НПО «Микроген»). Литическую активность бактериофагов изучали капельным методом на среде Мюллера-Хинтона по наличию зоны лизиса бактериальной культуры в месте нанесения бактериофага.
Результаты. Установлена низкая чувствительность культур к действию специфических бактериофагов, которые лизировали 37,5% штаммов клебсиелл и 41,4% штаммов протеев. Доля чувствительных к фагу Staphylococcus aureus составила 78,4%. Клебсиеллезный бактериофаг лизировал 56,7% штаммов Klebsiella pneumoniae и 18,3% Klebsiella oxytoca (χ2 =4,71, df=1, p=0,03). Протейный бактериофаг вызывал лизис 52% штаммов Proteus vulgaris и 35,6% Proteus mirabilis (χ2 =5,52, df=1, p=0,04). Установлено снижение литической активности фагов ко всем исследуемым видам условно-патогенных бактерий по мере усугубления дисбиотических нарушений микробиома.
Заключение. Микроорганизмы рода Klebsiella и Proteus, выделенные при нарушениях кишечного микробиома, характеризуются низкой чувствительностью к коммерческим бактериофагам.
Чувствительность условно-патогенных бактерий к специфическим бактериофагам снижается по мере усугубления микроэкологических нарушений.

1. Сулейманова З.Я., Устинова Н.В., Турти Т.В. Особенности гастроинтестинальных нарушений у детей с расстройствами аутистического спектра: обзор литературы. Педиатрическая фармакология. 2022;19(2):99-104. http://doi.org/10.15690/pf.v19i2.2397

2. Червинец В.М., Червинец Ю.В., Кравчук Э.С. Кишечный дисбаланс у молодых людей как маркер хронических соматических заболеваний. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2022;200(4):153-159. https://doi.org/10.31146/1682-8658-ecg-200-4-153-159

3. Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Роль микробиоты в регуляции гомеостаза организма человека при инфекции. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020;97(5):456-467. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-5-8

4. Grylls A, Seidler K., Neil J. Link between microbiota and hypertension: Focus on LPS/TLR4 pathway in endothelial dysfunction and vascular inflammation, and therapeutic implication of probiotics. Biomed Pharmacother. 2021;137:111334. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2021.111334

5. Горелов А.В., Мелехина Е.В., Сидельникова Э.С. Профилактика нарушений биоценоза у детей с острыми респираторными инфекциями, получающих антибактериальную терапию. Русский медицинский журнал. 2019;10:26-31

6. Stewardson AJ, Vervoort J, Adriaenssens N, Coenen S, Godycki-Cwirko M, Kowalczyk A, Huttner BD, Lammens C, Malhotra-Kumar S, Goossens H, Harbarth S; SATURN WP1 Study Group; SATURN WP3 Study Group. Effect of outpatient antibiotics for urinary tract infections on antimicrobial resistance among commensal Enterobacteriaceae: a multinational prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2018;24(9):972-979. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2017.12.026

7. Плотникова Е.Ю., Захарова Ю.В. Антибиотики как модуляторы кишечной микробиоты: между добром и злом. Русский медицинский журнал. 2018;11(II):131-136.

8. Hsu CL, Duan Y, Fouts DE, Schnab B. Intestinal virome and therapeutic potential of bacteriophages in liver disease. J Hepatol. 2021;75(6):1465-1475. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2021.08.003

9. Shkoporov AN, Hill C. Bacteriophages of the Human Gut: The "Known Unknown" of the Microbiome. Cell Host Microbe. 2019;25(2):195-209. https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.01.017

10. Mahmoud ERA, Ahmed HAH, Abo-senna ASM, Riad OKM, Rahman Abo- Shadi MM Al. Isolation and characterization of six gamma-irradiated bacteriophages specific for MRSA and VRSA isolated from skin infections. Journal of Radiation Research and Applied Sciences. 2021;14(1):34-43 https://doi.org/10.1080/16878507.2020.1795564

11. Саперкин Н.В., Ковалишена О.В., Квашнина Д.В., Раузендал Э., Схолтен Р. Эффективность использования бактериофагов для лечения и профилактики инфекции: систематический обзор. Журнал инфектологии. 2019;11(4):19-30. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-4-19-30

12. Асланов Б.И., Зуева Л.П., Долгий А.А., Конев С.Д., Гришко Т.А. Эффективность применения бактериофагов против штаммов Pseudomonas aeruginosa, формирующих микробные биопленки. Профилактическая и клиническая медицина. 2020;77(4):40-45 https://doi.org/10.47843/2074-9120_2020_4_40

13. ОСТ 91500.11.0004-2003. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника. Введ. 2003-06-09. Москва: Московская медицинская академия имени И.М. Сеченова Минздрава России, 2003. 74 с.

14. Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике. Федеральные клинические (методические) рекомендации. Москва: 2014. 54 с.

15. Захарова Ю.В., Леванова Л.А., Штернис Т.А., Сухих А.С., Марковская А.А. Характеристика биологических свойств бифидобактерий при микроэкологических нарушениях кишечника у ВИЧ-инфицированных детей. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019;3:3-9. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-3-3-9

16. Booth SC, Rice SA. Influence of interspecies interactions on the spatial organization of dual species bacterial communities. Biofilm. 2020;2:100035. https://doi.org/10.1016/j.bioflm.2020.100035.