Популяционно-генетическое исследование мутации гена UGT1A1, ассоциированной со сниженной функцией печеночной УДФ-глюкуронилтрансферазы А1
https://doi.org/10.23946/2500-0764-2020-5-3-59-65
Аннотация
Цель. Определение частоты аллельных и генотипических вариантов полиморфного маркера rs8175347 гена UGT1A1 в выборке жителей Кемеровской области.
Материалы и методы. Проведено популяционно-генетическое исследование мутации гена UGT1A1, снижающей активность УДФ-глюкуронилтрансферазы А1. Группа обследованных включала жителей Кемеровской области русской национальности (64 мужчины и 68 женщин). Для генотипирования маркера rs8175347 использовались образцы ДНК, полученной из цельной периферической крови обследованных. Проводилась аллель-специфическая амплификация изучаемого участка с последующим электрофоретическим разделением ПЦР-продуктов. Определялись частоты аллельных и генотипических вариантов rs8175347.
Результаты. Частота минорного аллеля *28 маркера rs8175347, ассоциированного со сниженной функцией печеночного фермента UGT1A1, в изучаемой выборке составила 33,3%, а гомозиготного генотипа *28/*28 – 13,6%. Частота генотипа *28/*28 достоверно не отличалась у обследованных мужчин и женщин.
Заключение. Установленная частота генотипа *28/*28 гена UGT1A1 в изученной выборке позволяет предположить высокую распространенность среди населения физиологических отклонений, ассоциированных с мутацией данного гена. По-видимому, более 10% представителей рассматриваемой популяции имеют сниженную активность UGT1A1 и в различных условиях могут демонстрировать симптомокомплекс синдрома Жильбера, нежелательные лекарственные реакции в ходе фармакотерапии.
Ключевые слова
Об авторе
А. Н. ВолковРоссия
Волков Алексей Николаевич, кандидат биологических наук, доцент кафедры биологии с основами генетики и паразитологии; старший научный сотрудник Центральной научно-исследовательской лаборатории
650056, г. Кемерово, ул. Ворошилова, д. 22а
Список литературы
1. Plomin R, Haworth CM, Davis OS. Common disorders are quantitative traits. Nat Rev Genet. 2009;10(12):872-878. https://doi.org/10.1038/nrg2670
2. Cho JH, Gregersen PK. Genomics and the multifactorial nature of human autoimmune disease. N Engl J Med. 2011;365(17):1612-1623. https://doi.org/10.1056/NEJMra1100030
3. Visscher PM, Wray NR, Zhang Q, Sklar P, McCarthy MI, Brown MA, Yang J. 10 Years of GWAS discovery: biology, function, and translation. The Am J Hum Genet. 2017;101(1):5- 22. https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2017.06.005
4. Chang M, He L, Cai L. An overview of genome-wide association studies. Methods Mol Biol. 2018;1754:97-108. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7717-8_6
5. Волков А.Н., Цуркан Е.В. Мутация гена UGT1A1 как маркер высокого риска возникновения синдрома Жильбера: научно-прикладные аспекты. Анализ риска здоровью. 2019;2:123-129 [Volkov AN, Tsurkan EV. UGT1A1 gene mutation as a marker indicating there is a high risk of Gilbert's syndrome: theoretical and applied aspects. Health Risk Analysis. 2019;2:123-129. (In Russ.).] https://doi.org/10.21668/health.risk/2019.2.14
6. Strassburg CP. Hyperbilirubinemia syndromes (GilbertMeulengracht, Crigler-Najjar, Dubin-Johnson, and Rotor syndrome). Best Pract Res Clin Gastroenterol. 2010;24(5):555- 571. https://doi.org/10.1016/j.bpg.2010.07.007
7. Memon N, Weinberger BI, Hegyi T, Aleksunes LM. Inherited disorders of bilirubin clearance. Pediatr Res. 2016;79(3):378- 386. https://doi.org/10.1038/pr.2015.247
8. Innocenti F, Schilsky RL, Ramírez J, Janisch L, Undevia S, House LK, Das S, Wu K, Turcich M, Marsh R, Karrison T, Maitland ML, Salgia R, Ratain MJ. Dose-finding and pharmacokinetic study to optimize the dosing of irinotecan according to the UGT1A1 genotype of patients with cancer. J Clin Oncol. 2014;32(22):2328-2334. https://doi.org/10.1200/JCO.2014.55.2307
9. Wang LZ, Ramirez J, Yeo W, Chan MY, Thuya WL, Lau JY, Wan SC, Wong AL, Zee YK, Lim R, Lee SC, Ho PC, Lee HS, Chan A, Ansher S, Ratain MJ, Goh BC. Glucuronidation by UGT1A1 is the dominant pathway of the metabolic disposition of belinostat in liver cancer patients. PLoS One. 2013;8(1):e54522. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054522
10. Тимошкина Н.Н., Богомолова О.А., Жужеленко И.А., Кабанов С.Н., Калабанова Е.А., Миташок И.С., Светицкая Я.В., Водолажский Д.И. Исследование полиморфизмов генов UGT1A1 и DPYD у пациентов с колоректальным раком. Сибирский онкологический журнал. 2018;17(6):49- 56 [Timoshkina NN, Bogomolova OA, Zhuzhelenko IA, Kabanov SN, Kalabanova EA, Mitashok IS, Svetitskaya YV, Vodolazhskii DI. Study of polymorphisms of UGT1A1 and DPYD genes in chemotherapy for colorectal cancer. Siberian Journal of Oncology. 2018;17(6):49-56. (In Russ.).] https://doi.org/10.21294/1814-4861-2018-17-6-49-56
11. Волков А.Н., Хабиева С.М., Смирнова Е.Ю. Генодиагностика мутаций UGT1A1 в практике современной медицины. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(3):186-192 [Volkov AN, Khabieva SM, Smirnova EYu. The gene diagnostic of mutations UGT1A1 in practice of modern medicine. Russian Clinical Laboratory Diagnostics. 2018;63(3):186-192. (In Russ.).] https://doi.org/10.18821/0869-2084-2018-63-3-186-192
12. Girard H, Butler LM, Villeneuve L, Millikan RC, Sinha R, Sandler RS, Guillemette C. UGT1A1 and UGT1A9 functional variants, meat intake, and colon cancer, among Caucasians and African Americans. Mutat Res. 2008;644(1-2):56-63. https://doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2008.07.002
13. Fernández Salazara JM, Remacha Sevilla Á, del Río Conde E, Baiget Bastús M. Distribución del genotipo A(TA)7TAA asociado al síndrome de Gilbert en la población española. Med Clin (Barc). 2000;115(14): 540-541.
14. Biondi ML, Turri O, Dilillo D, Stival G, Guagnellini E. Contribution of the TATA-box genotype (Gilbert syndrome) to serum bilirubin concentrations in the Italian population. Clin Chem. 1999;45(6 Pt 1):897-898.
15. Marinkovic N, Pasalic D, Grskovic B, Ferencak G, Honović L, Rukavina AS. Genotype frequencies of UDPGlucuronosyltransferase 1A1 promoter gene polymorphism in the population of healthy Croatian pre-scholars. Col Antropol. 2008;32(3):725-729.
16. Te Morsche RH, Zusterzeel PL, Raijmakers MT, Roes EM, Steegers EA, Peters WH. Polymorphism in the promoter region of the bilirubin UDP-glucuronosyltransferase (Gilbert's syndrome) in healthy Dutch subjects. Hepatology. 2001;33(3):765. https://doi.org/10.1053/jhep.2001.0103303le03
17. Zhang A, Xing Q, Qin S, Du J, Wang L, Yu L, Li X, Xu L, Xu M, Feng G, He L. Intra-ethnic differences in genetic variants of the UGT-glucuronosyltransferase 1A1 gene in Chinese populations. Pharmacogenomics J. 2007;7(5):333-338. https://doi.org/10.1038/sj.tpj.6500424
18. Sato H, Uchida T, Toyota K, Kanno M, Hashimoto T, Watanabe M, Nakamura T, Tamiya G, Aoki K, Hayasaka K. Association of breast-fed neonatal hyperbilirubinemia with UGT1A1 polymorphisms: 211G4A (G71R) mutation becomes a risk factor under inadequate feeding. J Hum Genet. 2013;58(1):7-10. https://doi.org/10.1038/jhg.2012.116
19. Huo D, Kim HJ, Adebamowo CA, Ogundiran TO, Akang EE, Campbell O, Adenipekun A, Niu Q, Sveen L, Fackenthal JD, Fackenthal DL, Das S, Cox N, Di Rienzo A, Olopade OI. Genetic polymorphisms in uridine diphospho-glucuronosyltransferase 1A1 and breast cancer risk in Africans. Breast Cancer Res Treat. 2008;110(2):367-376. https://doi.org/10.1007/s10549-007-9720-7
20. Делягин В.М., Уразбагамбетов А.У. Медицинское сопровождение пациентов с семейными доброкачественными гипербилирубинемиями. РМЖ. 2008;16(18):1194-1198 [Delyagin VM, Urazbagambetov AU. Meditsinskoe soprovozhdenie patsientov s semeynymi dobrokachestvennymi giperbilirubinemiyami. Russian Medical Journal. 2008;16(18):1194-1198. (In Russ.).]
21. Lingenhel A, Kollerits B, Schwaiger JP, Hunt SC., Gress R, Hopkins PN, Schoenborn V, Heid IM, Kronenberg F. Serum bilirubin levels, UGT1A1 polymorphisms and risk for coronary artery disease. Exp Gerontol. 2008;43(12):1102-1107. https://doi.org/10.1016/j.exger.2008.08.047
Рецензия
Для цитирования:
Волков А.Н. Популяционно-генетическое исследование мутации гена UGT1A1, ассоциированной со сниженной функцией печеночной УДФ-глюкуронилтрансферазы А1. Фундаментальная и клиническая медицина. 2020;5(3):59-65. https://doi.org/10.23946/2500-0764-2020-5-3-59-65
For citation:
Volkov A.N. Population genetic research of the mutation in ugt1a1 gene associated with reduced activity of liver UDP-glucuronosyltransferase A1. Fundamental and Clinical Medicine. 2020;5(3):59-65. (In Russ.) https://doi.org/10.23946/2500-0764-2020-5-3-59-65